昔日的百鸟岛，在古晋的怒火之下颤抖不已，如同被雷神降罚，引出孔雀王的踪影，强迫他必须打开保护岛屿的弱水屏障。尽管孔雀王的身形在捆仙索的束缚下成为了无法动弹的囚徒，然而那个狡猾的华姝已经如飞鸟一般消失在天边，古晋寻找不到她的任何线索。孔雀王满口狂言，声称华姝即将进化为魔神而回来进行复仇，同时指出古晋显然正快步走向生命的尽头。为了避免在凤隐面前暴露自己的虚弱，古晋只能以一种欲盖弥彰的姿态表现出镇定，带着孔雀王回到天宫。
然而，孔雀王的毒计深深，他早就将弱水屏障和九渊煞狱连接起来，屏障破碎的同时，也意味着九渊煞狱结界的松动。修言在阻止冥起恢复自由的行动上展现了决心，他准备再一次牺牲自己，尽管这对他来说代价巨大。但是在内丹中的敖歌的滋养下，修言的力量恢复颇多，足够他在一段时间内加固结界。在向敖歌告别的时候，他以永别的姿态赋予三生石以自己的托付。他请求三生石守护三生，如果敖歌醒来后失忆，他希望以望钟楼隐匿修言楼的真实身份，他也希望敖歌永远忘掉他自己。
尽管修言走后，敖歌如同从长梦中醒来，虽有诸多迷茫与疑惑，然而三生石却强忍着自身的悲痛，一直避免提及修言的事。天宫即将迎来新的司职仙君，青衣偶然发现其中一位与闲善面貌极其相近，令她惊骇之余立刻上前行礼。但是，对方却显得惊恐不安，并且看上去年纪比青衣更小，只记得他是被神明引导来修炼道，除此以外的记忆全然消散，甚至连那位神明的相貌也记不清。
青衣引着这个男子去见古晋和凤隐，确认他与闲善密切相关，古晋翻开山门卷验证了过去的事情，并证实了这就是闲善的新的莲蓬。古晋将掌门之印交给青衣，强调了她重启大泽山的责任，并要求那个男子改成闲善的名字。而此时的宴爽已经真切感知到鸿奕对自己的真心，但却不愿意伤害和背叛濂溪，所以在面对鸿奕的时候，她总是保持冷淡的态度。
伤势稍微愈合后，宴爽独自前往梨花小屋，面对千年以来的点点滴滴，心中充满了无奈和惆怅。她满怀心事地回忆过去的温馨时光，濂溪最终也看破一切，明白了宴爽心中的挚爱并非自己，于是特地送出退婚书，力劝宴爽追寻属于自己的幸福。
之后的日子中，凤隐和青衣按照山门卷的指引，寻找大泽山的遗失的师兄弟们，唯独缺少了闲竹的记录。青衣想起古晋曾经对她说过的话，急忙赶往青龙台，果然在那里碰见了对青龙台有极大敌意的闲竹，并成功将他收入大泽山门下。
闲竹同样是被神人引导修炼道的，他还留下了神人的画像，上面的人正是古晋。看到这情景，凤隐大吃一惊，心底却隐隐有种不安。当她匆忙前往清池宫找古晋时，却发现古晋已然陷入半昏迷状态，全身如空气一般地变得通透。
长阕向凤隐解释了实情，表示古晋为了复活大泽山，消耗了大部分的神元，剩下的一部分在修言育养阿音的时候用光了。现在的古晋，是靠着混沌之力勉强维持肉体的形态，当凤隐看到这样的古晋，她的心仿佛被万箭穿心，痛彻肺腑。知道了事情真相的凤隐，她才顿悟何为真正的两全其美之法。
看到古晋此刻的模样，让凤隐无比心痛，她终于明悟，始终陪在古晋身边，无论他逐渐苏醒，又或者是虚弱无力。在她的眼中，这两全其美之法根本不是两全，需要以古晋的生命为代价。面对这样的状况，凤隐无能为力，只能无奈的看着自己所爱的人一步步走向消亡。所以，凤隐发誓，不惜一切代价，一定要复活古晋。
在时间的长河里，青衣已经召集了众师兄弟的同仁之力，肩负希望与重担的古晋，将他们的智慧与力量凝聚，共同推动大泽山的再次繁荣。而在另一侧，忠诚无私的凤隐为挽救古晋的生命，无数次踏入高耸云端的天宫，试图从古老的篇章中探索造物之秘。可惜时常面对空荡书架，发现被寻找的典籍早已不翼而飞。
焦急万分的凤隐，迫于无奈，向博学多识的文曲星求证，究竟是何人先行一步，将这秘籍借去。面对凤隐的追问，文曲星难以抗拒，披露了借书之人的真正身份。那原藏于古籍之中的史记，记载了一种神秘的方法，据说借助祖神的注记，极有可能唤醒元神池之水，灌溉生命的枯井。但代价非同小可，需以自己的本源作为献祭，才能实现这一令人祈盼的奇迹。回想当初，仪合真神为了救治帝眷，不惜耗费了混沌本源，虽是真神，神元安然便能长存于世。而若凤隐效仿此法，其结局将无疑是身灭神消。
正因为这样的悲剧潜能，古晋不忍凤隐步入绝境，因此计划之中让长阕秘密取回这篇典籍，以防灾祸降临于身。当凤隐洞察到这背后的真相，紧急寻找古晋，泪目而诉，质问其为何要隐瞒这重大的秘密。看似万全的古晋，为稳住凤隐的心，虚言身体安康如旧，谁知这场谎言很快便被剑灵无情地揭穿。在凤隐执着的追问下，剑灵只能坦承，古晋的生命之火恐怕只剩最后的三月光景。古晋坦承自己早已失去了阿音，绝不望眼睁睁看着自己的爱人凤隐，再走阿音当年的老路。
争论之间，艳红之绸从外探来，口中带着一线生机，言说九渊煞狱之深处尚存有一种名为元神晶的物事，或能代替本源，唤醒元神池内的生命之源。凤隐闻言不加思索，即刻踏上了前往九渊煞狱的不归路。然而古晋心知煞狱的危险，哀求不愿眼见心爱之人置身险地。伏尘剑并青衣同样焦急奔来，劝说凤隐，而在众人的恳求加诸古晋的眷恋下，凤隐宣布将放弃此次搏命之行。
晨曦初现时分，凤隐携着古晋走向后山禁谷，精心地将梨花酿替换为百日醉，打算与古晋共赏那承载往昔的皮影戏。然而当古晋反应过来时，早已无法抗拒酒意，陷入了控制不住的沉眠。接着，凤隐带伏尘剑抵达修言楼，三生石的显现透露出修言遭遇了不测，她决心要唤醒敖歌，以便救出修言。
拥有重新唤起的记忆的敖歌，早就饱含救援修言之志。但因九渊煞狱结界脆弱，若贸然行事，存有冥起趁虚而出的巨大风险。敖歌提议，在行动前，定需策划无懈可击的计划。二人研究修言的日记，期待能找到破解此局的关键。古晋此时亦抵达幽洺界，笑称早已洞悉凤隐之计，故事先指示剑灵将酒替换。
古晋揭露了古神取混沌之力化为凡间的故事，三界至高的帝玺锻造界碑，自此三界各安其位，互不干扰。凤隐从古晋的话语中获得了启发，认为如果能够卸除三界界碑，将三气合而为一，即便没能得到真神之元，仍能封印住那神秘的九渊。敖歌虽担忧界碑一旦拆除，可能会有人乘机作乱，但在古晋保证自有对策后，成功获得了敖歌的同意。
而在妖界，鸿奕为了救助宴爽，自断尾巴，这令其余长老怀有不满。他们带领群妖高举旗帜，企图对鸿奕发难。伤痕累累的鸿奕身陷重围，险些颜面尽失，幸得宴爽及时现身，以妖后自居，挥斥方遒，轻而易举镇压了那些愤怒的声音，让众人无不俯首称臣。见证了这个奇迹的古晋和凤隐，不失时机地向鸿奕借取徽记，鸿奕慷慨将之交出。
宴爽为鸿奕解除了围困，并打算辞行离去。鸿奕却以婚书为由留住她。意料之外，那所谓的婚书不过是张空白文纸。鸿奕借此向宴爽表明心迹，终于感动了宴爽，两颗心在明月之下紧紧相连，结成了佳偶。旋即，凤隐一行人向凤渊借帝玺封印九渊，而凤渊告知，帝玺早已不在他的掌控之中，取之唯有过硬的九宫塔，夺得天帝之位。
天帝选拔之日如约而至，凤隐、玉霞子、万仪山主身影均在人群中若隐若现，连天河老祖也纷纷添足阵容，加入这场争霸。鸿奕率领着妖界众妖秘密驻守西侧，待机行事，他们与古晋、宴爽等人相互协作，联防魔军，以阻截其肆虐的步伐。整个三界在这个关键时刻，诸神仙妖共同执掌命运之剑，迎接着未知的明天。
在九宫塔这座神秘的大舞台上，奇妙的挑战等待着每一位仙族精英。拔尖者踏入第一道关卡，必须接受对仙基的严峻考验，无数道天雷，带着宿命之力，落下，验证着他们的品质与实力。凤隐与玉霞子，这两位仙途上的各有卓越的前行者，踏入其中以接受考验。尚未完全揭晓的命运让人屏息，然而造化弄人，玉霞子竟然涉猎了禁忌的天宫术法，引得天河老祖愤然将其驱逐，犹如一道退场令，戛然而止了他的征途。
当凤隐如期克服难关，来到了第二道门槛——幻境之地。在此，宁静的大泽山环抱着她，仿佛一切流年静好，百态人生在这里上演。此时，闲善尚未执掌主教之位，东华仙子仍然留恋于大泽山间，师兄弟间的互助和情深似海。在一派温情脉脉中，东华仙子的声音在空气里回荡，宣布要将阿音收为闭门弟子，这突如其来的消息让在场的每一个人不禁激动地鼓起掌来。被关怀包围的阿音，在闲善递上的剑穗触动下，回神，她明白还有更重要的事情等待自己去完成，刻下内心虽有不舍，却也必须坚定地迈开步伐。
而在华姝伪装的万仪山庄里，却上演着另一出戏。明知一切不过是幻境，她还是沉浸在梦境中，希冀着和澜沣帝君的婚姻。即便在这一切美好背后潜藏着危机，澜沣帝君的剑锋对她展现，她也不愿醒来。青穹仙尊的出现，为这场幻境画上了休止符，却也揭示了华姝的失败。失败之余，情绪失控的华姝反手杀害了青穹仙尊，她的内心，充满了无法宣泄的恨意。
灵风仙子急速穿梭，向古晋报告魔族悄然侵入的消息，万仪山庄的庄主竟是华姝所化，古晋不得不通过竹蜻蜓紧急通知凤隐。竹蜻蜓最终落入了九宫塔内的鉴武殿之中。凤隐的睿智让她识破了华姝的真面目，却也认清现实的无奈，原来这场较量中，她并非对手。帝玺最终还是落入了华姝的手中，两人一同步出了九宫塔。
外界的仙族们面对突如其来的情况，心中波涛澎湃。华姝手持帝玺现身，魔气四溢，震撼了每一位在场的仙族。宴爽等众人计谋已定，欲以孔雀王为要挟制服华姝，无奈孔雀王却向华姝传递信息，商讨不可交出帝玺，并迅速拿出聚妖幡以自保。聚妖幡一展之下，孔雀王挣脱了所有束缚，自信至极，在一片呐喊中表现了其嚣张之态。
凤隐、古晋、鸿奕和宴爽，他们联手意图阻拦华姝打开渡世妖门，以避免那无穷的祸患波及三界。然而，孔雀王的强大加之聚妖幡的帮助，使得对华姝的制止显得异常艰难。无奈之下，凤隐只得摊开真相，讲述了澜沣帝君遇害的内情。孔雀王至初还强言否认，直至红雀的出现，她亲口讲出亲眼所见的真相，孔雀王也不再遮掩，事实面前无所遁形。本打算趁乱将众仙制服，不料，孔雀王的计划因红雀一展即垮。
孔雀王深知华姝已无法依靠，他决然施展催心咒法，强迫华姝释放魔修，以打开通往渡世妖门的道路。瞬间，漫天黑雾遮蔽了天宫，这个曾矗立了万古长青的圣地，却笼罩在一片不可驱散的暗影之中。
凤隐则以自身的净化力量唤醒了华姝，使其恢复了理智。她静静地、温柔地请求华姝信任自己，接着为修魔的族人净化了魔气，杀死了华姝心中挚爱的父亲华默。接下来，华姝带领着族人拜倒在凤隐脚下，她坦言自己滔天大罪，请求耗尽仙元将魔族永远封印于聚妖幡内，并希望天界能放过她的族人。凤渊宣布了凤隐成为新天帝，将决定权交予她，而凤隐自然允诺了华姝的诉求。
这场爱恨纠葛终于尘埃落定，华姝耗尽仙元之前留下的遗言，表明了她对与凤隐的比较。她自知不及凤隐，唯有一事与之旗鼓相当——那就是同样拥有能放弃一切的爱情。众人见证了华姝封印聚妖幡的精神，但魔气仍旧弥漫，冥起已然现身。尽管仅是其残影，却依旧令众仙感到了莫大的威胁。
追踪至百鸟岛的废墟，冥起正企图吞噬此地被封印的魔气，意图打开那通往九渊炼狱的禁忌之门。凤隐、古晋、鸿奕、宴爽和敖歌五位仙界英杰联合起来，汇聚三界之力与之对抗。然而，冥起却出其不意以修言相威胁，敖歌转瞬间落入了算计之中。
当黑暗的魔神冥起施展其强大之力，毫不费力的破坏三界之间的阵法时，一股险恶的气息在宁静的天地间肆意蔓延。在这紧要关头，素有混沌之体之称的古晋挺身而出，凝视着九渊炼狱深处那即将冲破束缚的邪恶存在。他深知，一旦本体冲出，三界难免陷入永久的混战与毁灭。为了保护诸世界的安宁，古晋不顾一切地释放了自己混沌的本源力量，用其封印住了那摇摇欲坠的九渊。他的混沌之身随之碎灭，神格也宣告无法保全。古晋在挚爱凤隐的臂弯间缓缓倒下，悠长的呼吸成为永恒的遗憾，带着对未来的无限不舍，在那一刻，他的灵魂选择了飘散。
这惊心动魄的牺牲在在场的众仙面前上演，每一个心灵都被无尽的悲哀覆盖，他们无言以对，目睹这悲壮的牺牲。凤隐在悲痛中哭泣着，恳求着力量超绝的凤渊和碧波等人施以援手。但命运无法逆转，古晋真的从这个天地中消失无踪，连同他的剑灵一起，没有留下任何存续于世的痕迹。在这个容不得任何改变的终局之前，凤隐黯然神伤，忍痛直到昏厥过去，并在无情的事实面前显出了其深深的脆弱。
悲痛的时光在凤隐藏不住心中的悲泣中缓缓流逝。为了重铸古晋的生命，她在连绵不绝的岁月里，孤身走访了万水千山，穷尽各种手段，甚至冒着生命的危险，强闯了高高在上的神界，只为寻求那位至高无上的仪合真神的援手。在这漫长寻觅的路上，跨越三界的旧友如鸿奕和宴爽，以及众多大泽山的师兄弟们慷慨加入助她一臂之力。面对仪合真神的无能为力，所有希望都如水上泡沫般破灭。凤隐对自己尚未能成神感到万念俱灰，仪合真神在她心中的灯火也随之渐渐湮灭。
曾经与古晋共同守护三界的长阕，也在这时将离开凡尘归返神界。在告别前，他真诚地对凤隐说出祝福，希望她能够继续坚强，保重蒂珍的肉身，因为宿命赋予她的重任是保护三界的安危。凤隐在这番话的感召下，将心中所有复杂的情感凝练成一股坚定的力量，发誓要守护好属于他们的三界。
修言，一位了不起的神明，在此刻决意直接寻见魔神冥起，以一份坚持和勇敢，试图说服这位恶名昭彰的存在去兑现他曾对古晋作出过的承诺。他向冥起传达了一个深刻的观点：天命并非一成不变，命运同样可以被改写。身为魔神的冥起并不一定要与诸仙永远对立，他也可以拥有一片属于自己的天空，逐求自己真正向往的生活。
伴随着时光的流转，凤隐终于由仙升为天帝，诸位神仙对她的尊崇和祝贺纷至沓来。而在这重要的时刻，修言携手凤隐前往冥起的隐居地，请求冥起与仪合真神共同施以神力，重塑古晋的混沌本源。在万事具备之下，并非一朝一夕。这混沌本源需要长时间的养育与修行，准确的重生时机要看天意。
修言将一座贮存了混沌之力的镇魂塔交给凤隐，提醒她，只要她携着塔去吸纳万物灵气，古晋的重生之日就会更加临近。冥起与仪合真神的帮助，就如同点亮了昏暗中的明灯，充满希望的光芒。于是决心解下天帝之位，传给敖歌以继续护佑三界，而自己则带着镇魂塔踏遍山川湖海，采集世间所有精华与温暖。
忽转眼间，千年时光悠悠过去。在和平共处的仙妖两界间，凤隐依旧坚守着自己的誓言，辗转于各地，以收集必须的灵气来达成心愿。与此同时，在这片安宁的岁月里，鸿奕和宴爽无数次推迟的婚礼，最终得以筹备，感谢那位一心为儿子操心的鹰王之催促。凤隐亲自动手给宴爽打扮，挽发送嫁，她甚至取出了深藏多年的梨花酿，作为祝福与馈赠。在众目睽睽之下，鸿奕与宴爽合拜了天地，喜悦的气氛笼罩全场。
在婚礼上，敖歌满含深情地前来献上祝福，三生石悄然间将两颗心紧紧联系在了一起。而恰在这一刻，一位特殊的身影——剑灵从天降临，欢欣的气息瞬间传遍四方，这标志着古晋已终于获得重生。在人群的欢庆之中，凤隐却一个人独坐于梨花林中，见证着那一片片花瓣随风起舞，她决定拿出镇魂塔收集灵气，却见它化作青烟消散。
她顺着这缕温暖的烟雾望去，便见到了久别的古晋静静地站在梨花树下，他们泪眼相对，面带笑容。就在这一瞬，所有的辛苦和哀愁都化成云烟。而在远离的幽洺界中，冥起也来到修言所在，询问是否愿意帮其下凡历练，体验人生的百态。修言对这唯一美好的请求露出了微笑，虽然前无古人，他却愿意与冥起一同追寻未知的旅程。
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