段云鹏在毛人凤为他设置送行酒席上夸口，“这次回大陆要是干不成一两件大事，绝不回台湾”。与此同时，我公安系统得到了段云鹏要潜入大陆的消息。刚刚到任的公安局局长林子风向罗瑞卿报告，段云鹏最近要再次潜回大陆，主要任务是刺杀主席。罗瑞卿当即指示，这是个大祸害，一定要在他潜入境内时逮捕他。
由于上次行动的失利，此次段云鹏潜入变得十分谨慎，他躲在香港迟迟不敢入境。罗瑞卿指挥北京、天津等地公安干警联合行动，并在段的身边建立“内线”，成功地在广州将段诱捕。
根据党中央指示，罗瑞卿领导和组织了对解放初期全国关押的日本战犯和伪满洲国战犯的劳动改造工作，其中包括伪满洲国皇帝爱新觉罗·溥仪。罗瑞卿往返于抚顺战犯管理所及各监狱之间，对战犯的起居饮食都很关心。他还告诫战犯管理人员，不要轻视改造战犯的工作，通过艰苦细致的工作使他们认识自己的罪行，改造成新人。