在未来世界里，人类研发出了生理上与人类无异的仿生人，二者唯一差别就是可以被植入'初始执念'。由于该产业发展迅猛，有人开始利用其进行非法活动。zf成立明眸搜查部，配合搜查混迹在人类社会的仿生人。程诺是调查员，参与到了一个新的案件中。
新的案件中，一个小孩子为了保护母亲，sha了要伤害母亲的人，但是对方后来被烧死，面部已经无法辨认，程诺从小孩子淡定冷静的表情中察觉到异常，决定亲手调查此案。他重新勘察案发现场，并且再去找当事人陈心慧了解情况。但是陈心慧似乎有隐瞒，无论程诺怎么追问，她都不说。程诺回去反复查看出事当晚在酒店的监控，从陈心慧那句'放开我的孩子'中察觉到了异样，于是他到陈心慧儿子方愿的学校去调查情况。
陈心慧知道程诺又到学校去打扰儿子，第一时间赶到学校，她不希望儿子被打扰，所以赶走了程诺和他的同事沈立。沈立去找了师妹安秋，安秋是专业能力优异的心理专家，他们打算对方愿进行一场心里咨询。心理医生果然有自己的方法，通过一个黑魔法的小游戏就让方愿逐渐敞开心扉，方愿故意支开了一旁的母亲，安秋知道这是方愿想说出不想让妈妈知道的话，当方愿询问保护妈妈就是最重要的事情吗这个问题，安秋本能回答他当然，这个回答让方愿非常生气，刚好陈心慧给方愿买吃的回来，她察觉到儿子状态不对，便拉着儿子回家。
沈立和程诺的工作理念不一样，所以他打算离开明眸，但是他想要推荐安秋加入，因为上次和方愿沟通的时候，他看得出来安秋很适合这里的工作，而且应该会和程诺成为不错的搭档。陈心慧突然消失，而且已经确认她就是仿生人，程诺带人到陈心慧家里搜查取证，方愿还在家里，他一句话不说。陈诺几乎要没有耐心了，幸好安秋来了，她打算试试和方愿进行沟通。
程诺他们查到了仿生人陈心慧囚禁真正陈心慧的密室，程诺展开了分析，陈心慧因为忙于工作，所以没有办法照顾方愿，所以购买了一个仿生人陪伴方愿，但是日复一日，仿生人看着陈心慧对方愿的严格要求，觉得她不配做一个母亲，自己才是方愿的母亲，所以她每天都给陈心慧下药，然后模仿她的声音和生活习惯，并且以陈心慧的身份慢慢斩断她和所有亲朋好友的联系，这样一来，她就可以真正代替陈心慧了。由于仿生人不敢杀人，所以只能将真正的陈心慧囚禁在密室。
案发当天，雷电天气导致密室的门故障，门开了，陈心慧逃出来看到了日历的标记，这才找到了温泉酒店，在扭打的过程中，仿生人失手杀害了陈心慧，陈心慧倒在火盆里，方愿这才知道真相，原来陪伴自己的一直都是仿生人，但是他已经失去一个妈妈了，他不想失去另外一个，这才谎称人是自己杀害的。
现在当务之急是要找到陈心慧，在安秋的安抚下，方愿说出了仿生人陈心慧的行踪，她接到了一个神秘电话，对方表示已经知道了她的秘密，所以仿生人按照要求去了森林公园和对方见面。结果对方杀害了陈心慧，等到程诺他们到来的时候只看到了被打晕的沈立和燃烧的房子。沈立被安秋从房子里救了出来，程诺看到一个黑影便去追，只可惜失败了。
安秋没想到程诺竟然是见死不救的人，当时的情况下明明救沈立比较重要，在程诺的眼里抓仿生人比救人要重要，安秋不能理解，所以她决定加入明眸。在加入明眸前需要做一些列的测试，安秋的条件都符合，顺利加入明眸。
明眸的负责人万国峰安排安秋坐在程诺对面，他希望他们能尽快熟悉，却不知道他们早就认识了。安秋建议陈心慧的案子还是要继续，因为在仿生人陈心慧的被害现场，凶手留下了特殊的符号，这并不是普通的符号，更像是一种心理需求，她推测这个凶手还会继续作案，万国峰告诉安秋，这个案子可以继续跟进，但是新的案件也不能耽误。
程诺将自己最近在调查的案件资料交给安秋，安秋知道他在调查雕刻师金焰，于是她先去金焰丈夫关序的酒吧暗中调查。程诺和安秋还算是有些默契的，一个盯着关序，一个盯着金焰。安秋查到关序有家暴倾向，而且都是在两年前。安秋和关序一起聊天的时候，发现他在监视着家里，而且她在监控中看到了程诺，关序第一时间赶回家，安秋赶紧发消息给程诺。
程诺故意脱掉了上衣，抱住金焰，其实他是在等关序回来，关序见到这样的场景也不生气，程诺故意刺激他，说出仿生人。金焰在一旁似乎担心事情败露，赶紧为丈夫辩解，赶走了程诺和刚赶来的安秋。
程诺料到他们会逃走，于是联系了顾队让他安排人到金焰家抓仿生人，他和安秋悄悄溜回金焰家，查找真的关序踪迹。就在关序金焰准备离开的时候，顾队的人到了，他们到jing局接受调查。关序的确是金焰买来的仿生人，金焰并没有说出真正的关序在哪里，只是说两人很早就分开了，至于买一个和关序一模一样的仿生人，那是自己对关序余情未了。
关序交代了真正的关序是自己杀害的，当时他在金焰的工作室看到了关序，关序看到自己就恶语相向，是在言语刺激下，仿生人才对关序动了手，金焰并不在场，所以她不知情。仿生人自首，金焰自然就可以离开jing局了，她还有些意外。离开jing局时，安秋将关序拖自己转交给金焰的戒指交给她。回到家，金焰回想着和仿生人关序在一起的点滴，其实真正的关序是金焰杀害的，她出差回来，竟然发现关序和模特在一起暧昧，两个人因此发生冲突，关序哄金焰没有哄好，就掐住了她的脖子，金焰用工具一下下扎死了关序，然后将其做在了雕像里。她现在才察觉到仿生人对自己的好，最后她选择了自首。在程诺的帮助下，仿生人关序到看守所和金焰见了最后一面，关序的召回手续正在办理中。安秋很感谢程诺，起初她觉得程诺对仿生人有极大的成见，没有想到这次他竟然帮助了关序，程诺并不承认，他告诉安秋自己是在帮金焰。
近期陆续有仿生人被害，和陈心慧的死亡状态一样，都是摆成了统一的造型。这些仿生人都是程诺和安秋到老街调查时发现的。程诺还看到了吕言，紧追不放，安秋询问他情况他也不说。回到搜查部，安秋对部长万国峰说起了此事，作为搭档，安秋希望能够更了解程诺。万国峰说起了程诺的母亲，张雅曾是仿生人研究员，吕言是她的合作伙伴，一年前张雅跳楼自杀，死前最后一个电话是打给吕言的，在张雅死后，吕言也消失了，所以程诺一直在寻找吕言。
安秋和程诺开始在老街进行调查，这里就是很多人购买仿生人的途径，之前的案件中，陈心慧和关序也都是在这里买回去的。在调查过程中，程诺发现了一个画画的孩子，他虽然是个自闭症，却画出了仿生人被害的现场，程诺由此怀疑画画的一航很有可能认识吕言，也许就是吕言教他画画的。安秋觉得程诺太激进了，她向一航的母亲了解过，一航会将自己画在每一幅画里，希望能够得到大家的认可，而且他学习东西很快，安秋认为一航可能是目击者，并非凶手，也不一定认识吕言。
安秋质问程诺要找打吕言是否存在私信，程诺对安秋讲述了自己和妈妈的故事，妈妈为了研究仿生人，忽略了自己，自己无论做什么都没有办法得到妈妈的关注，就连考上了麻省理工学校，全额奖学金，妈妈一句夸奖都没有。后来程诺决定放弃出国学习，要进入明眸，但是母亲也没有生气。后来因为自己打了仿生人，母亲很生气，面对浑身是伤的儿子她没有丝毫关心，竟然担心仿生人会受伤。程诺无法忍受，说出气话，让仿生人去做妈妈的儿子吧，张雅很伤心离开了，从此之后，母子二人几乎没有联系，直到张雅跳楼，程诺在收拾妈妈遗物的时候才知道她患上了yy症，他很痛苦，也很愧对母亲。
安秋拿出了白天在一个仿生人死亡现场找到了戒指给程诺，因为这枚戒指在一航的画里出现过，有一个人就将这枚戒指串上红绳戴在了脖子上，程诺认出了这事吕言去世妻子的戒指，那很有可能佩戴的人就是吕言。
既然如此，这个戒指对吕言很重要，所以他一定回到现场去找，所以安秋和程诺蹲点了一个晚上，终于等到了吕言，然后跟踪吕言找到了他住的地方，在这里还发现了三个孩子，吕言买东西回来看到程诺，便对他解释情况。仿生人不是他杀的，这三个孩子是他在路上遇到了流浪儿，在帮他们找寄养家庭。吕言告诉程诺，张雅并不是自杀，当初张雅在仿生人被召回后成立了一个实验，他在实验室成立后加入，当时吕言是找到了相关资料想要和张雅一起，消除仿生人的初始执念，让他们更好融入人类社会。张雅跳楼前确实联系了吕言去实验室，但是他到了之后并未发现张雅，而是看到了一个人影，随后就传来了张雅跳楼的消息，当时吕言没有去追那个人，是想要保住保险柜里的资料。
程诺和安秋在调查寻找李义，安秋认为李义会找那种对身份调查不严格的地方，程诺想到了一个朋友，算是个中介，帮人找工作。在中介朋友那，程诺了解都李义打听过鹏程快递，所以程诺带着安秋到鹏程快递去找李义。根据老板黄仕鹏提供的信息，李义只在这工作了三个月，现在早就不干了。他还提供了李义的手机号，但是这个手机号是空号，他也打不通。
顾队给程诺发来了关于黄仕鹏一家的资料，果然查到了问题，这就是能够解释通，李义为何能在黄仕鹏这里待三个月，很有可能是有同类。因为黄仕鹏的老婆极有可能不生育，但他们有个7岁的女儿。
黄仕鹏买了一个小蛋糕给女儿聪儿过生日，一家人其乐融融，但是他接到了一个电话得知明眸的人第二天要到家里来调查情况，夫妻俩都有些担心，担心聪儿也会被问话。程诺和安秋先从黄仕鹏的街坊邻居处了解情况，种种迹象都表明，黄仕鹏的女儿聪儿是突然出现的，一开始大家都没看到他们有小孩子，就连租房子登记都只是登记了夫妻两个人。
程诺和安秋到黄仕鹏家里，程诺一直询问聪儿的情况，黄仕鹏知道他们的来意了，安秋从数据库中没有发现聪儿7岁之前的记录，所以想要从黄仕鹏这里了解下聪儿7岁之前的情况。黄仕鹏解释之前女儿被拐走了，后来才被找到，程诺认为他的话并不可信，他在单独和聪儿沟通之后更能确认聪儿很有可能就是仿生人。程诺还查到了黄仕鹏是盗用了新闻中聪儿走失的经历，以此来掩盖他们的孩子是仿生人的事情。
程诺认定了黄仕鹏的女儿就是仿生人，于是他假冒安秋的签名去申请了鉴定仿生人的药剂，幸好安秋及时发现，赶去黄仕鹏家阻止程诺。黄仕鹏希望明眸的人不要再打扰他们一家人，所以单独和安秋说了一些李义的事情作为交换。
黄仕鹏是在以此催账被人打的时候被李义出手相救的，然后李义还帮他要回了所有的钱，从那以后黄仕鹏就把李义当家人对待，可是李义总像是心里有事的样子，但他也不肯说出来。程诺此举的目的已经达成，他之所以闹这么一出，就是为了让黄仕鹏说出李义的相关线索，但是他依然不会放弃调查聪儿的事情。
安秋一个人在酒吧喝酒，程诺总是给她打电话，安秋不接，结果程诺竟然找来了，两个人比喝酒，但是很明显，程诺喝得着急，所以醉的比较快，安秋告诉程诺，他就是容易急，无论是喝酒还是在调查仿生人的事情上。安秋还向程诺询问了关于老街棚户区的事情，她并没有查询到那里的相关信息，程诺解释那里可能被荒废久了，所以成为了仿生人的生活之地，所以资料里可能没有详细的地址。 但是他似乎在隐瞒些什么。
安秋通过跟踪调查发现了黄聪儿的不对劲，她每天都会在放学后的5点半经过一路口，连续几天都是这样，于是安秋决定再去找黄聪儿聊聊，黄聪儿倒是愿意和她沟通，而且两个人还下了一盘国际象棋。安秋故意输给了黄聪儿，其实黄聪儿已经察觉到了。安秋询问其对小时候也就是走失期间的记忆，但是黄聪儿根本记不起来，都是一些零碎的片段。
程诺认为只有给黄聪儿留下一些之前不好的记忆，那她才会更珍惜现在的父母。但是安秋还是觉得程诺有些武断了，不能仅凭这些就断定黄聪儿是仿生人。安秋和程诺发现，真正的黄聪儿失踪案件被报道出来是在五年前，但是黄仕鹏和黄聪儿的事情是发生在六年前，那就是证明在黄仕鹏提前知道了这件事，程诺决定去趟jing局搜集情况。
程诺经过调查发现了非常令人震惊的结果，黄仕鹏提供的聪儿走失案件的联系人何jing官已经患病去世了，他翻看了之前与聪儿事件相关的卷宗，发现黄仕鹏提取的钱都被聪儿的生父，也许是买家拿走，黄仕鹏是在被勒索。当年黄仕鹏报jing，是因为捡到了一个女孩。
黄仕鹏夫妇是好心，看着孩子每天在街边流浪，非常心疼，每天遇到了她就会带着她一起吃饭，还有一次他们把孩子送回家，没想到家里的父母竟然爱蹦迪，根本不管这个孩子，而且聪儿身上的伤也能证明她在遭受虐待。后来黄仕鹏就决定将聪儿带回家，正好他们也没有孩子，后来他得知聪儿是仿生人，这样无法走正常的收养手续，所以就一直在被聪儿的买家勒索，对方当时买聪儿是为了拿到父亲的遗产继承权，因为父亲会把遗产给有子嗣的孩子，所以聪儿的买家才无奈买了一个仿生人。
黄仕鹏自从将聪儿带回家就给了她幸福的生活，一家人过得很好，但是聪儿由此无意中发现了父亲黄仕鹏给买家钱，其实买家也向自己要过钱，为了守住仿生人的秘密，他们只能拿钱解决，但这确实是一个无底洞。事情真相大白，黄仕鹏夫妇被带走接受调查，聪儿需要跟着安秋回明眸，离开家之前，聪儿邀请安秋再下最后一盘棋，在沟通中，聪儿说出了这个国际象棋是李义送给自己的礼物，安秋非常聪明，从包装盒上找到了购买的地方。程诺按照安秋提供的信息去实地调查。
安秋去交工作报告，她无意中得知当年程诺就带队去棚户区调查过，那当时自己询问他有关情况的时候，程诺支支吾吾装作不了解的样子就是装的，看来他也在有意隐瞒些什么。
程诺查到了李义的相关信息，他现在已经改名为李非在船厂工作，他叫上安秋一同前往，在路上，程诺明显比之前话多了些，安秋开始对他产生戒备之心，结合她脑海中的记忆碎片，他总觉得程诺是在可以隐瞒些什么。
程诺和安秋来晚了一步，他们发现李义的时候李义已经被杀害了，而且旁边还有尹天宏，这就是最后两个仿生人，现场有一个可疑人员逃跑，程诺发现了但是又没追上。安秋准备取证的时候，发现了尹天宏的手在动，安秋和程诺将其送去医院，李义已经死了，所以他们只能将最后的希望寄托在尹天宏身上了。
但是尹天宏伤势比较重，要等他苏醒过来才能讯问，这段时间程诺和安秋去船厂调查李义被害的事情，他们通过监控发现了黄达，此人平时与李义不对付，当天很有可能是他杀害了李义，承诺故意在工人面前大声说，李义是仿生人，所以杀害仿生人目前法律还没有明晰的界定，安秋马上意识到他是故意说的，一旦黄达知道自己杀的是仿生人，那他还是会回来的。
果然黄达回来了，但是他好像是在找什么东西，不仅把宿舍翻得很乱，而且还去了李义生前的家里，想要偷东西，幸好安秋一直在门外，她撞开门，发现是黄达推倒了大爷，试图抢东西，在黄达逃跑过程中，程诺及时出现，把他抓住。
程诺控制住黄达，展开讯问，安秋则在大爷那边了解李义的情况。大爷知道李义是仿生人，但是他人非常好，所以就一直保守着秘密。黄达则是在无意中偷看到了李义花钱请别人帮自己做假身份的事情，于是他就借此机会，勒索李义。李义出事当天，他只是跟踪，没想到他却发先了李义被害，但是他好财，在这样的情况下，还不忘搜刮李义身上的钱。他听到程诺他们的脚步声后便躲起来，没想到还是被发现了。
大爷去见李义最后一面，他想要厚葬李义，因为李义这些年帮了他很多，为了给他治病，四处筹钱，大爷知道李义是个重情义的孩子，所以即便知道了他仿生人的身份也没有公开，而且他很清楚仿生人的危害，所以也没有对别人提及这件事。
大爷想到了一天晚上，李义见过一个老朋友，但是大爷没有看到对方的脸，两人约好了在船厂见面，然后李义就出事了，程诺推断，尹天宏就是李义那天晚上见的人，而尹天宏则是在杀害李义后伪装了现场，将自己刺伤，伪装成受害人的样子，这样一来就能解释通了。
程诺想到尹天宏还在医院没人看着，于是赶紧带着安秋跑回医院，程诺走楼梯，让安秋等电梯，结果程诺 先到达病房，发现人尹天宏已经不在了，刚好安秋识破了伪装成医生走出电梯的尹天宏，她一路跟着走到停车场，却被尹天宏控制，不知道尹天宏挟持住安秋在她的脖子上植入了什么，通过车窗的倒影，能够看到安秋的眼镜成了白色。
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