华陀(林文龙饰)自幼聪慧过人，醉心医学，在因缘际遇下拜名医张仲景为师，一次关云长(尹阳明饰)带同乡求医，华陀发现此人的症状有异，不是普通伤寒故将伤寒论与滋阴论结合，成功研究出治疗瘟疫之法，藉百姓迷信鬼神之说，加上小人得志，对华陀诸多加害，使其惹上杀身之祸，时张仲景之长女张妙心(伍咏薇饰)与华陀两情相悦，决心下嫁并随夫逃亡。华陀移居许昌后行医，不论病得多重的人也全力拯救，结果往往失败，被评为‘医死人大夫’生活每况愈下，而后华陀替曹操(黄日华饰)的幼儿医好多年顽疾，得曹操赏识封为太医院监，着手撰写医学大全，不过好景不常，曹操的奸雄本色渐露，命华陀制毒药杀害关羽之士兵，华陀不耻曹操所为，因而投靠关羽，又因曹操偏头痛病发作，老羞成怒，以斩杀太医院内三百余人作为要胁，逼迫华陀返回许昌治病，华陀此行凶多吉少，莫非这就是命运的安排？
