他们曾是恋人，曾是夫妻，如今却走向离婚的道路。从甜蜜到吵架，从关心到误会，他们之间的感情已经走到了尽头。如果有机会互换身份，相互理解，或许能少很多矛盾，少很多痛苦。基于这样的心情，作者创作了《恩爱两不疑》。
故事发生在一个古老的城市，文治城内。大晟时期，城主夫人徐钰得知她的父亲归来，不惜身穿大臣的衣服也要与他见上一面。自从徐钰与文治帝萧锦昀大婚后，她的父亲就一直在边疆。此次重逢，徐钰发现她的父亲已经老了许多。
城主萧锦昀是个富有智慧和思考的领袖，对军功累累的徐父也有所警惕。徐父在朝上提出的建议没有得到萧锦昀的批准，并遭到大臣的指责。看不惯这种局面的徐钰毫不犹豫地站出来为父亲支持，并且穿着大臣的衣服偷偷出现在朝廷，引起了轰动。为了平息此事，徐父把责任都推到了自己身上，愿意替女儿受罚。萧锦昀不得不让徐钰下跪认错，并让城主夫人自己处理这个事情。萧锦昀则离开了朝堂。
徐钰的行动也引起了后宫的波澜。皇宫中的贵妃裴心竹感到自己的地位岌岌可危，便带着一群妃子前往城主夫人的宫殿，想要观望这场闹剧。毕竟，这样的大事情还是很少发生的。
内院之内，主母正斥责着城主夫人徐钰，要她让出正位。徐钰却始终不愿意，坚持要萧锦昀亲口休妻，否则她一直都是城主夫人。主母被气得不轻，而徐钰则起身走向萧锦昀。此时，裴心竹正在拼命煽风点火，却被主母严厉批评，指出母凭子贵，自我提升才是最重要的。虽然徐钰平日里对大家都很友好，但只有他的贴身太监在萧锦昀面前为她求情。萧锦昀认为，如果不休妻子的话，所有事情就无法收场。这个时候，徐钰的父亲带来了外族进犯的消息，表示会立即离城备战。萧锦昀立刻放下了之前的计划，徐钰在殿外遇到自己的父亲，两人难得见面。徐父把在边境捡到的珠子送给了徐钰，却没时间等她递上平安符。
萧锦昀警告徐钰要好好在内院待着，随后去了主母那里。萧锦昀无子，这是主母一直以来的心病，于是她开始安排选秀女的事情。徐钰在院子里练剑，姿态优美，萧锦昀看到这一幕，误以为她已释怀。萧锦昀拿来一本册子，让徐钰帮自己选秀女。徐钰则口出恶言，甚至激动地把萧锦昀推进池塘中。恍惚中，徐钰看到萧锦昀于水中苏醒，赶紧跳入水中为其救命，并以吻渡气。
再次醒来，徐钰惊讶地发现自己变成了萧锦昀，主母在她的身边悉心照料。徐钰一时糊涂，急忙赶走了主母，确认这并不是梦境后，彻底惊呆了。裴心竹得知萧锦昀苏醒的消息，立即跑去找他，哭哭啼啼。徐钰看着她差点扑上来的身影，立刻让她为自己祈福。与此同时，萧锦昀醒来，发现自己变成了徐钰，还没来得及反应，主母就闯了进来，发现这个奇怪的情况。
