在没有麻药和手术刀的情况下，燕双鹰凭着惊人的毅力要求进行手术，孙医生用燕双鹰的刀顺利取出子弹，燕双鹰的性命得以保住。几天的朝夕相处以及生死经历，使得莎莉对燕双鹰的感情慢慢起了变化，然而燕双鹰仍然与其保持距离。
军管会召开会议，各位领导反省了自己的工作，吴玉霞提出当下的四项工作，一是取消对燕双鹰的通缉，二是追查王主任身份，三是抚恤死去战士的家属，四是将赵铁钢调入风雷小组。
此时的老板与其下属秘密藏身于歌乐山被废弃的防空洞里，这里不仅有他们的特务老巢，还有一间病毒实验室，佐藤等731部队的日本研究员正在此处研发并制造新型病毒，它比二号病毒更易传播和扩散。
黑狼带着雅琴三人回到基地，没有处理掉燕双鹰的他令老板非常失望。老板要求赵雅琴按照他们的要求制造炸弹，赵雅琴和林玉仙正义直言，宁死不屈，老板下令枪毙两人……
