神舟一号飞船发射前夕，仲人和指挥部成员到烈士陵园祭奠萧亮，缅怀他为载人航天做出的贡献。莫茹对此感慨万千。着陆场、测控船人员全部到位，全系统做好了飞船发射准备，仲令风也走进地面模拟舱坐飞船同步飞行试验，神舟飞船成功发射……
飞船发射成功后，仲人和指挥部成员全部赶往北京指挥中心等待飞船返回的消息，飞船就要进入返回测控段了，测控船传来的数据却显示飞船运行轨道错误，有人担心是日凌中断干扰了测控船，张再面临很大压力，刘大谋赶紧让地面模拟舱作补充试验件车飞船性能，结果正常。仲人当机立断，飞船按预定的理论数据进行测控，飞船返回调姿成功……
十几分钟后，飞船返回预定着陆点，地面模拟舱里的仲令风坚持到了飞船落地的最后一刻，但他却因为飞船舱内有害气体超标而中毒，岳武侯林兮急忙将仲令风送往医院，仲令风昏迷不醒……
面对地面模拟舱里发生的意外，说明飞船离载人飞行还有很长一段距离，仲人要飞船系统半年之内攻破难关，加快工程的节奏，争取早一天把航天员送上太空。祝庆久担心仲令风中毒的事给航天员造成负面压力，影响训练，林兮却建议仲人将飞船不完善的情况告诉航天员们，让航天员有充分的思想准备，要面对就必须要承受……
一个多月后，海上测控船队回来了，仲令雨看到其他人都有家人前来迎接，唯独自己孤身一人，对父母哥哥都为工程忙碌的事很是感慨。他对测控船的新鲜感已经过去，私下里筹备着自己的下一步打算……