李饼携手大理寺官员急速抵达码头，在那里，他们目睹了一幕令人不寒而栗的景象——一具尸体蜷缩在龙王庙外，姿态十分异常。刑部已经将尸体从龙王雕像背后的隐蔽处移出，并初步判断此人系因头部遭受重击致死。现场留有把棍棒，这是码头上常用的运货工具。刑部进一步透露，死者名为刘福，担任码头看管一职。此信息一经汇总，李饼立刻意识到，案件的破解并非难事。见状，刑部官员立刻提出，希望大理寺能接手此案，以此来压制金吾卫的声势。
刑部人员离去后，阿里巴巴试图通过自己的想象来描绘案发经过，但李饼认为其推理过于戏剧化。王七提出了自己的看法：刘福作为货场看守，夜间肯定在巡查期间有所发现，因此遭到了杀害。根据现场情况和刘福的职责来看，凶手很有可能是一名惯偷。李饼对王七的推理表示更多的认同。与此同时，陈拾对龙王雕像的细节表现出浓厚兴趣，他感觉雕像的手中应当握着某物。细心察看后，在地上找到了一块掉落的木牌，尽管上面的文字模糊不清。李饼进一步调查，发现龙王像内部竟是空心的，推断这应是惯偷用以藏匿赃物的隐秘处所。地面散落的丁香与豆蔻等高价值香料表明，所盗之物必定价值不菲。他推测，刘福可能参与了监守自盗的行动，为了厘清事件真相，派遣人手四散去货场侦查。
王七走访货场，试图进一步了解受害者刘福的情况，却发现所有搬运工仿佛躲避瘟疫般躲着他。李饼与陈拾则转向一家酒馆，在那里进一步探听是否有货物在近期内失窃。他们的调查被突如其来的铃铛声打断，所有在场的食客均表现出异常的避讳，连酒馆老板也急忙催促他们早些离开，声称自己近来忙碌，不愿接待生客。李饼留意到桌上遗留的酒水，发现其味道与龙王庙内的酒瓶相同。准备离开时，一个意味深长的叹息从一位叫花子口中传来。李饼随即截住此人，试图用银子换取关于码头近期发生事情的信息。叫花子向他透露，由于漕运滞缓，许多人开始涉足盗窃，这在当地已成为不言而喻的常态。
阿里巴巴利用自己胡人的身份，登上一艘同胞经营的货船进行打听，从船员口中得知，前几晚确有一艘豪华货船匆匆靠岸，停留时间不过半小时便匆匆离去。关于船只停留的记录，码头上原本是有详细记载的，但当李饼查看时，记录已被人故意涂抹覆盖。在记录牌下方，他发现了血迹，随即沿着线索追至岸边，却见到一名黑衣蒙面女子留下一只飞镖后迅速消失。就在此时，邱庆之率领的金吾卫赶到，询问案件进展情况。
回到大理寺，李饼推理认为，刘福可能与惯偷属于同一伙人，并且事发之夜很可能发生了内部矛盾，导致了悲剧的发生。船情牌被故意涂抹，显然是为了掩盖船只实际靠岸的事实。而王七则认定，那名黑衣蒙面女子就是背后的真凶，不过由于陈拾被挟持而让凶手得以逃脱，对此王七对陈拾颇有微词，认为他既无助于解案，反倒造成了阻碍。陈拾无意间听闻了他们对自己的评价，内心感到异常沮丧，甚至怀疑自己是否适合留在大理寺。在情绪低落时，他找到了袁不二并向其诉说心声。袁不二却意外地拿出一封自称来自陈九的信件，这让陈拾感到十分欣慰。带着这份突如其来的惊喜，他将信件带回大理寺，希望李饼能从信中找到有用的线索。
青楼之中，李饼寻得一位黑衣姑娘，就是那日于码头挟持陈拾的人。随着镖踪，他找到了这位伪装成胡人的黑衣女，黑衣女称未从凶案中涉足，却向李饼坦白自己正在追查与花有关的物品。那李饼曾在酒楼遇见的叫花子，命运如同他所收的两块碎银一样破碎，他被冷酷地戮杀了，尽管赏金未动，仵作验尸后，发觉其死因与刘福实乃如出一辙，推断凶手身份相同。
在金吾卫欲介入码头命案之际，上官认为此为其正常职责，但李饼略觉不适。上官檎拟以自身之力分散邱庆之的注意力，李饼则依然得在货场搜集线索，然明镜堂的几人均在此调查过,故需如影隐形的行动，王七为此一番变装，睅扮出新身，再一次来到货场。
扣之陈拾，他每日在袁不二的摊位，询问哥哥的近况。一次偶遇，使他发现原来经常购买水的走商和自己有着相似的面容，落笔一问，算是得知了弟弟的存在。接到哥哥的信，陈拾如同得宝，满心期待地向车夫求去哥哥的居所，车夫也答应了。
王七和崔倍化身为苦力，阿里巴巴孙豹装扮为富商，希望用手中的富饶引来窃贼。然而，风水轮流转，一场努力下来，他们反被潜藏在黑暗中的头目所抓，困于船舱之下。崔倍质疑几个强盗，问他们是否也是刘福和叫花子的杀手，强盗却毫无畏惧，称自己曾为兵，死者多如牛毛，多杀几个无关痛痒，且笑着在船底刨了个洞，让水充斥整个船舱。
李饼和上官檎在船舱中等待，邱庆之立马带着金吾卫出现，陈拾原本欲去找哥哥，现在却因此向水车夫暂且告别。金吾卫救出了王七等人，凶手至此也无处可逃，李饼这才明白一切：剧情之大反转，原来是邱庆之在下黑手。无法阻止金吾卫带离疑犯，李饼因此苦恼无比。
陈拾回归到舞台，他誓要离开大理寺，向李饼表明立场，李饼万分懊悔，感到为了求成短期内的效果过于苛求陈拾，亦明了陈拾初衷只是寻亲，李饼内心顿时沉甸甸的。尽管王七等人尽力挽留，陈拾却坚定要去寻找哥哥，承诺找到哥哥后会努力考取大理寺。与此同时，他把在码头发现的金吾卫箭支交给李饼，让李饼明了一切都是邱庆之的阴谋。
李饼与上官檎找到金吾卫要求回人质，然而只换得邱庆之的一席话，他怒称三个工贼早已经死于酷刑之下，面对这样的结果，李饼只能愤然。这时，陈拾再一次寻来水车夫，两人来到一处仓库，得知此处就是陈九的住处，水车夫更是拿出了半张当票，让陈拾知道，另外半张在当铺，可见陈九早已经安排妥当。
最后李饼带着明镜堂的人重返码头龙王庙，王七坦言，也许他们的初步调查方向就是错误的。李饼反复推敲，意识到凶手应该在某个地位，可以掩耳盗铃。再一次看到龙王手中的木牌，现在却变为一张水牌，打破了所有疑困。
陈拾与水车夫老程一同抵达仓库，收下了截断的文书，然后前往各处的当铺进行核对。在一家当铺，老板意外地找出了文书的另一半，并且当铺老板手中的一个荷包与老程失而复得的荷包不仅同款，而且有着颇为相似的状况，这使得陈拾颇为疑虑，而老程曾表示过那荷包是自己母亲亲手缝制的。在如此巨大的都市中，居然如此轻易就找到了他的哥哥，一种莫名的恐慌让陈拾欲离去，然后却被老程从背后袭击，让他昏了过去。
此时，李饼与明镜堂的成员在龙王庙发现了水牌，突然想起了陈拾在离开大理寺前提到的水车夫的事情。他们怀疑陈拾可能已经落入了水车夫的圈套中，并开始了紧张的寻找。等到陈拾醒来时，他发现自己已经被老程捆绑，坐在货箱边，老程的目光似乎并不带有恶意。陈拾小心翼翼地开始询问实情，老程最终披露了真相，刘福的死真的是他一手造成的。
他们原本都是从军队退役后为生活奔波的啤人，然而近年来交通不便，生活困难，所以他们开始在仓库中行窃。派赃的地点便是龙王庙，在一次行窃当中，他们偷取了一个箱子，而开箱后的物品令老程的心头涌上了痛苦的回忆。他和弟弟曾共同参军，弟弟因被当做窃贼而误杀，当时涉及的物品与他们现在盗来的物品相同，而这当然让他心有所感，希望能将此物销毁以解心头之恨。然而刘福贪婪地以该物追名利，终因纷争而被老程杀死。
复杂的故事让人唏嘘，如同一场悲剧不断上演。然而，李饼带领的人马突然闯入，控制了老程并解救了陈拾。该案件的迷雾越来越稀少，然而还是有一些疑点混乱不堪。刘福明明对老程表示过自己并未在货物标识上留下任何痕迹，那么是谁暗中追踪，导致了这场冲突的发生？崔倍和李饼在此处都感到困惑。
返回到大理寺，明镜堂的众人得到了嘉奖。陈拾也侥幸做出明智的选择，立下了战功。当李饼询问陈拾是否有离开大理寺的打算时，陈拾表示他将会全心全意的投入学习，以便尽早加入大理寺的考试。
在另一方面，上官琏夫妻的女儿被叫回府上品茶，父母询问她关于公务上的问题。上官琏懈怠无比，责备上官檎与邱庆之作对，如果不是他多次进行斡旋，恐怕多次会有死伤事件发生。邱庆之是朝中红人，上官一家想少些惹事，夫人提到准备为上官檎找一个门当户对的婚姻，上官檎对此却不以为然，于是早早地向父母道别，返回了大理寺。
李饼再次找到了青楼蒙面女子，想从她那里获取更多线索，女子告诉他，自己要找的东西与名叫杜子虚的西域人有关。三年前，杜子虚出现在礼部尚书府，神秘地使老去的礼部尚书又重获青春，然后就再也没有人见过他。而随后，兵部将一个新的案件交给了大理寺。
国子祭酒秦纾的胞弟秦纨早晨被发现遭人谋杀。李饼赶到现场进行调查，原来房间中充斥着大量五石散，上官檎则感到尸体的异味，走到院子中呼吸新鲜空气。阿里巴巴将带有冷气的薄荷膏送过来，然后他们发现院墙边的箱子贮物歪斜满地，显然是杀人凶手逃跑时留下的痕迹。
在秦纨的院子中发现了含血的猫爪印，推测这或许是一个线索。上官檎建议从这点开始调查，然而，李饼则持有另一种看法。由于五石散的储存需要冰块，在院墙角落的箱子底部发现了水迹，他们推测这是冰融化后留下的，于是他们猜测可能前一晚有人给秦纨送冰过。他们决定首先去调查神都的几处冰库。便让李饼和陈拾去秦府探查，而自己则带着明镜堂的伙计一并去探问。
上官檎和明镜堂的伙计们到达冰库进行调查，期间王七突然建议分开行动，他似乎是想给阿里巴巴和上官檎一个独自相处的机会。接着上官檎和阿里巴巴找到一个冰库，这冰库的掌柜告诉他们，昨天并没有秦姓的人来购冰，并且在午后,冰铺就已经停工了。掌柜还顺便向他们透露，有个伞将杜成昨天来买了冰底子，他平时也很喜欢食用五石散。
另一边，李饼和陈拾的调查也开始进行。他们找到了秦纨的哥哥秦纾，他不仅是国子祭酒，还是太学的主持人。秦纾对于他们的询问显然十分反感，他告诉他们，秦纨已被他从家中赶了出去，而秦纨在外的一切行为都与他没有任何关连。不过，在吴伯的陪同下，他们得知了更多关于秦纨的过去。秦纨从小就不是那么的聪颖，但他对音乐的理解却很深。然而，由于家中环境严谨，他逐渐生出畏惧，甚至得了口吃。之后的几年里，秦纨似乎改变了自己，开始更加上进，但他在一个友人家中做客时闹了个大丑，之后便被秦纾下逐出家门。
同时，王七和崔倍也进行了他们的调查，跟太学的师傅打听到的信息与李饼他们类似。但他们还得知，如果想了解更多关于秦纨的信息，需要去找鸿胪寺的寺卿。上官檎和阿里巴巴来到伞将的门店时，看见一道鲜艳的油纸伞背后正在滴血，约莫猜测这与杀人案有关。他们推开油纸伞，看到一个男子倒在地上，与此同时，另一个男子准备向上官檎发起攻击，阿里巴巴推开上官檎并立刻通知其他人。
李饼和仵作赶到现场，经过查看，确定现场的这个男子也是服食五石散后死亡的。王七猜测这个男子就是曾给秦纨送过冰块的人。而在门后，他们找到一个木箱，箱内有着奇异的香味，并且还有一条手帕和一张秦纨的欠条。崔倍通过调查发现，这个死亡的男子叫杜成，在他受伤后便离开了画院，开始制作油纸伞以为生。
他们猜测手帕可能是用来盖琴的，于是上官檎去了典当铺。掌柜告诉他，一把琴被一个女子典当走了，同时她也留下了一把穗子。李饼和陈拾找到了这位蒙面的女子，对方说五石散与杜子虚的神药配方相似，只是少了药引。她说她只是听说过药引是一种动物骨骼制成的。
王七找到寺卿后，了解到秦纨曾做过的丑事。寺卿说，秦纨曾被秦纾带去接受考核。考核的时候秦纨的表现很差，一度让秦纾对他失望。三个月前，秦纨找到寺卿，希望寺卿能帮他向秦纾求情，让他尽快回家。但从现场的情况看，似乎这个请求并未被秦纾答应。
李饼询问了蒙面女子对药引的调查动机，女子告诉他，她的父亲和杜子虚一起在船运事业中被害。她认为杜子虚与一枝花坐过牢有关系，所以想找到一枝花，因为他可能知道她父亲惨死的真相。
李饼与明镜堂的成员正聚精会神地讨论秦纨的情况，他们怀疑秦纨可能并未说出真相。由于长时间心理压力过大，秦纨对五石散的依赖让人感到难以摆脱。此时，阿里巴巴一脸沮丧地回到了明镜堂，因为他未能成功跟踪上官檎。
上官檎在追踪中找到了一家饰品店，店内一幕令人震惊——女店主寇娘被绑在椅子上，嘴中塞满布条，无法言语。上官檎立即通知李饼和团队成员，当他们赶到现场时，获悉女店主寇娘原是杜成的红颜知己。寇娘回忆，杜成曾托她从当铺赎回一条琴弦，但杜成日常生活拮据，其突然出现的巨款来源令人疑惑。寇娘还透露，杜成与秦纨关系密切，秦纨家境丰裕且擅长制作五石散，两人常一同服用药品。
上官檎联想到，秦纨和杜成可能都遭到了某个药贩的杀害。这名药贩首先联手杜成除掉秦纨，然后又杀死杜成以灭口。王七回忆，杜成曾因腰伤从一名药贩那里购买药物，而此人正是五石散在升平坊的主要供应者赵大仙。
李饼和上官檎率团队找到赵大仙的藏身地，只见他正在进行某种神秘仪式。李饼命令捉拿赵大仙，不料赵大仙突然服用了一颗五石散，力量大增，将王七和孙豹震飞数米。不久，赵大仙因连续服药过多而毒发身亡。队伍将其尸体运出洞穴，而李饼在案场发现一把琴弦和一些粉末，推断这是秦纨将五石散藏匿之所。
在进一步调查中，上官檎注意到寇娘一直在寻找的穗子上含有杜若的成分，这一发现引领他们回到兰心饰坊，却见到秦纾也因毒发身亡的场景。寇娘最终与明镜堂的成员返回大理寺，揭露了整件事情的来龙去脉。原来，寇娘与秦纨情投意合，为了帮助秦纨摆脱对五石散的依赖，两人计划共结连理。但秦纾对此强烈反对，甚至频繁施暴于秦纨。
在真相大白后，上官檎并未独占功劳，而是将功绩归于阿里巴巴。李饼虽然解决了此案，但内心仍有许多疑问未解。从初期的线索到后来的证据，似乎有一个无形的手在引导他们解案。随着清明节的临近，神都流传着关于节日里鬼怪缠身的传说。
王七忙于在明镜堂门前挂艾草以驱邪避鬼，并分享了许多关于清明附身的怪异故事。陈拾被吓得不轻，李饼推开门进来，给正聚精会神听故事的众人一个惊喜。随即，众人意识到整日未见崔倍踪影，而对此并未觉得异常，毕竟崔倍往年此时总会消失一段时间。也许，他有他的秘密和故事。
陈拾对李饼讲述的鬼故事的真实性感到好奇，李饼则是轻描淡写地解释，这些不过是人心生的鬼，稍稍给陈拾一些勇气。正当两人离开书房时，却见崔倍匆匆忙忙地返回自己房间，连招呼也未打，增添了几分神秘的氛围。
于洋涉雾的明镜堂内，众人沉浸在深思中。据他们所知，崔倍与袁不二有着深厚的关系，可能是由于对清明煞气重的巷头谣言一味相信，寻找袁不二进行求卜验证。他们在找到袁不二后，事实却恰好与他们的猜测相符。袁不二告诉崔倍，尽管当前正值清明，煞气笼罩，但只要在清明期间找一个背山的地方待上几天，尽量远离人群，就可以避免被煞气侵扰。
从明镜堂经历悠悠岁月，李饼带领众人回到大理寺。他们在崔倍的房间进行了一番细细的寻觅，孙豹在注意到崔倍确实有准备过夜的两件衣物外，也发现了崔倍明显出去后的迹象。此刻，王七突然想起了去年清明之后崔倍回到大理寺时的那个情景，他的衬衣下摆都湿漉漉的，周边有水源的阴山只有天池山了。而此时，正当李饼翻看崔倍笔记的时候，一个衙役跑来报告说，前几天，监狱遭惨遭雷击，犯人四处逃逸。虽然经过一段时间的追捕，基本已经将这些逃犯全部抓回，然而，其中却有一位江洋大盗尚在逍遥。他们刚接到密报，有人目睹这位犯人劫持了一辆马车，然后身影消失在天池山麓，抛弃马车后只身上山。李饼快速做出反应，立即下令，全队前往天池山，一起追捕这位江洋大盗。
几人凭借已有的线索，赶到天池山下，他们发现了通往山上的三条小路。李饼依赖常识和洞察力，找到了落叶较少的一条。崔倍每年都会去天池山，对那里的环境熟悉得宛如己出，他们决定以搜捕逃犯为主要任务。行至半山腰，李饼差点脚下踏空，厚厚的落叶层之下熏人的臭气让人毛骨悚然。陈拾判断出这是马粪的味道，经过长时间发酵，马粪中的水分几乎都已经挥发，剩下的就是干散的粉末般物质。陈拾踩到马粪，踩得散落的落叶上也沾染上注有颜色的干粉。此外，附近还有几处痕迹，有的形状像人的脚印，这无疑说明逃犯也是走的同一条路。
崔倍找到山背面的道观，敲响大门，张真人走上前来迎接他。崔倍向张真人提问，说他在路上捡到一块玉佩，不知是否是张真人失落的。张真人接过玉佩，催促崔倍尽早开始进行除晦仪式。崔倍收拾完房间，献上一些银两，张真人便在河边为崔倍举行了除晦仪式。验毕后，崔倍感觉这次的仪式与以往差异颇大，较为简短，对此，张真人解释，这不会影响除晦仪式的效果。
在山顶附近，李饼独自登上一颗大树，目光远望，发现在山背面有一处道观。很快，一只小猫爬到李饼的身边，李饼因此一时分神，从树上掉了下来。众人解释为李饼沾染了煞气，但是李饼却不以为耍。他认为，既然有小猫，那些附近一定就有人居住。他刚望见的那个道观，无疑就是这个人的住处。
逃犯比李饼提早一步来到道观，敲响了大门。崔倍告诉他，张真人去山里采药了，于是逃犯就住在道观里等待。然而，到了夜晚，道观的客房突然发生了火灾。张真人全然无计可施，崔倍则是捂湿了一件衣服，挺身冲进了烈火，成功救出了逃犯。这时，李饼带着众人刚好赶到。
第二日，王七将逃犯带回了大理寺。而崔倍则认为自己的煞气让道观遭到冲击，因此痛责自己。李饼却走到起火的房间进行查看，他发现了一条暗道。看着张真人显然不愿意让他们多逗留在房间，李饼便当面直言，揭穿了张真人。他认为张真人故意放火，是为了要烧死逃犯。张真人一脸无辜，李饼进一步解释说，逃犯专程来找张真人，这说明两人有深厚的关系。而张真人多年来深居简出，躲在深山之中，很可能是因为在躲避官府的追捕。他们可能是因为劫持了官储的银两，分赃之后，有一人被抓，那么剩下的人就只能躲藏起来，不能轻易露面。所以，即便张真人再怎么抵赖，李饼也能利用新铸的银子，将事实都戳破了。
崔倍得知明镜堂众人原来是主要为找他而来，深受感动。而这时，他却不禁想起了小时候，父亲带他去踏青的那些日子。他的母亲在他出生时，因难产而去世。从那时起，崔倍就一直认为自己讨厌，总是刻意与人保持距离，一直孤军奋战。甚至到了
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