在幽深的宅院里，层叠的回廊掩映着世家大族的盛与衰。夜色初临，秦菀细细诊察三老爷的病症，却在脉象之间捕捉到了隐晦的异常。并非寻常疾病，竟是毒素悄然潜伏。检视近来所用药材，秦菀辨出了金石之毒的痕迹——剂量巧妙得几乎无懈可击，足以致命于三老爷这等因杨梅毒而虚弱之人。她心头泛起忐忑，有杀机在府内四处潜行，于无声处催逼着一切走向覆灭的深渊。燕迟闻讯，神情黯然，知案情重大，若上报刑部，调查少则拖延半年。燕迟便恳请秦菀施展医术，解救三老爷，让罪人得以苟活，在公堂之上受尽法律制裁。秦菀深以为然，决心架起一桥，让真相浮上水面。
然而深夜静谧，纵有明灯高照，秦菀与燕迟依旧难以理清这重重谜雾。他们百思不得其解，秦老夫人为何极力维护三老爷之后又有急切滅口之举？种种诡秘，似是与井底埋尸案息息相关。十三具无名尸骨，见证了多年恩怨与鲜血凝结的仇恨。案中受害者家属之身影，是否已悄然潜入秦府门墙，在光影交错之中寻机复仇？秦菀携徐河暗自查验那些尸骨，终在细微之处觅得一具存在赘生痕迹者。这是杨氏的遗骨，她的女儿也终于有机会与母亲魂魄再聚。命运无常，世人皆知当年杨家主母离奇失踪后，火光席卷全宅，家道中落，杨氏的丈夫亦葬身火海。百姓对此事记忆犹新，却不知杨氏竟遗下两个女儿。长女姿容清雅，自力更生，昔日能躲过天灾人祸，今朝化作了复仇的无形之手。
一桩桩、一件件，皆与秦府遥遥牵连。秦菀与燕迟缜密剖析，推测杨氏的女儿如今年逾二十，若隐姓埋名潜身内宅，只为家破血仇，简直合情合理。夜色沉沉，秦菀银针扎入三老爷命门，施展回天之术。三老爷痛醒，满口谵妄，反复指控刘管家下蒙汗药迷倒十三姑娘，将她们无情抛入枯井。而典当行则明知三老爷嗜好，按时送来无辜少女。殊不知杨氏之女原本并非送入秦府的“货物”，却因杨氏追女心切自愿随女儿入府，从此天人永隔。三老爷至此仍无悔改之心，疯言疯语，丧心病狂，秦菀愤怒不已，几欲让其遭受锥心之痛。燕迟见状，急忙相劝，可混乱间，针尖却误扎入燕迟臂上，秦菀惊惶之下急忙施以解毒。
宅中暗流汹涌，采荷送来一柄光彩艳丽的油纸伞，落在秦菀眼中却满溢疑云。采荷乃老夫人贴身女侍，历惯风浪，本该处事圆滑，怎会如此匆忙？燕迟心中灵光一闪，镇妖石失窃，正是复仇的首轮棋子；杀机四伏，猎人步步为营。莲叶之死，或许终能揭开这一切的序幕。查阅画像无果，库房中翻找女子画像亦无下落，唯有一幅落款大哥姓名的画像存疑，画中所绘竟并非大嫂本尊。所有与杨氏相关的画卷均已销毁，线索中断。眼下锦囊之策，只能追查镇妖石之秘。
月色如水，紫竹林中幽影憧憧。秦菀与燕迟谨慎进入林中探查，细观镇妖石四周遗痕，终得结论：竹子坚韧无比，正被用作撬动重石的工具，两人齐心即可移开镇妖石。真凶聪慧绝伦，大胆而周密。此时，燕迟已下令查封庆源典当行，截断消息流通之路的同时，亦震慑幕后主使。典当行老板虽被擒，仍咆哮威胁，言辞嚣张，声称背后之人连燕迟都惹不起。然而燕迟无所畏惧，立即部署追查真正的主谋。
疑云不散，秦菀再次前往探询二哥，追查莲叶之死的真相。莲叶命丧紫竹林一事，扑朔迷离。彼时二哥急召秦菀看病，亲见大哥鬼鬼祟祟潜入竹林。而莲叶入府早于采荷，本有资格晋升，却被采荷越级挤占，心生怨怼。她苦苦追踪，终于抓住采荷入院那一日的大哥行迹。秦菀推断，莲叶或亲眼见证大哥与采荷的秘密情感，因此遭杀人灭口。暗线浮现，采荷正是杨氏之女，这一切环环相扣，皆为复仇偈咒。
昔日杨氏夫君，患有色盲，遗传后代。燕迟在得此关键讯息后，目光陡然一亮，立即联想到采荷身上。谜底愈发清晰，秦菀叮嘱下人赶紧将采荷之名传至燕迟耳中。然纵有智计，还是有人捷足先登——晚棠将消息提前透露于大哥。大哥决意连夜带采荷私奔，只求秦菀延缓通知知府，为此竟舍家弃妻，不顾一切。
气氛紧张窒息，秦菀激问他是否能因私人之情滥杀无辜。大哥怒不可遏，将秦菀推倒在地。自从他看清三老爷肆意为恶的真面目后，日夜煎熬，希望亲手处死仇人。大哥哽咽道，如今采荷已为自己放下仇恨，不图复仇，可真正欲报血仇之人其实是自己。采荷自甘付出，甚至放弃名分、忍辱为妾，大哥对此心有不忍，遂执意替她完成那份沉重的复仇。
真相终于逼近深渊，秦菀赤心利语道破——采荷曾于嫂嫂药中暗下麝香，决非温柔无害的女子。她狼子野心，要得秦家三房绝嗣。情深义重，终究被血仇与野心扭曲成冷酷利刃。大哥却死心塌地护着采荷，不容人生半分诋毁。他心生极命，将秦菀堵在斗室之内，抽出绳索，欲亲手勒死这一切真相的揭示者。杀机凝结，似连满园的风露都在颤抖……
欲望、仇恨、亲情、背叛交织出隐秘的悲歌。秦府大厦将倾，正义和黑暗不再仅仅对立，人与人之间最深的哀愁与挣扎，在烛火浮影下缓缓堆积。命运如同一场棋局，善恶是非早已难辨，唯有那些被伤害、被遗忘的灵魂，徘徊在静夜深处，等待着晨曦照耀真相。
